Peler et émincer les oignons. Les faire revenir à feu moyen avec l'huile d'olive environ 10 minutes en mélangeant régulièrement. Lorsque les oignons sont translucides, ajouter le miel et prolonger la cuisson quelques minutes pour bien les caraméliser. Réserver.
Dans un cul de poule, mélanger au fouet les oeufs, le fromage frais et la crème. Saler et poivrer à sa convenance.
Ajouter les oignons caramélisés. Mélanger et répartir dans les empreintes individuelles.
Parsemer un peu de fromage râpé sur chaque clafoutis (facultatif) avant d'enfourner à 170°C et cuire 23 à 24 minutes.
Démouler délicatement et servir nature ou accompagné d'une sauce de son choix.